Титанус и его организация С.М.У.Т.А вернулись, и на этот раз они планируют построить Космическую платформу, чтобы заполучить потерянный трансформатор с военной базы. Титанус создает нового мутанта под названием Синапс, существо чистой энергии, которое может контролировать все механическое. Черепахи должны остановить Титануса и разрушить его коварные планы раз и навсегда.
