После того, как Технодром снова оказывается на поверхности, Шреддер и Крэнг захватывают Черепашек и отправляют их в измерение X, где они становятся рабами. Тем временем, Шреддер и Крэнг снова возвращаются на Землю чтобы опять попытаться захватить мир.